Ciencia en Linux: AIST:RIO-DB una grandiosa base de datos de espectros de compuestos orgánicos

Buen día estimados lectores, les escribo nuevamente después de una muy prolongada ausencia debida a la alta carga académica a la que estuve sometido este semestre, para quienes aún no lo saben actualmente estoy cursando el octavo semestre de química, motivo por el cual no he podido estar muy al tanto de la movida tecnológica reciente y por el que además he decido dirigir, dentro de lo posible mis próximas entradas a la divulgación de herramientas que faciliten el desarrollo de actividades científicas obviamente de la mano de nuestro amado pingüino.

Y para inaugurar esta serie de entradas dirigidas a la producción y desarrollo de la ciencia de manera prioritaria en sistemas GNU/Linux, comparto con ustedes un recurso que conocí durante el desarrollo de este semestre y me ha resultado demasiado valioso para mi formación académica se trata de la base de datos de espectros de compuestos orgánicos AIST:RIO-DB, un recurso con un una extensa cantidad de espectros de resonancia magnética nuclear (RMN), infrarrojo, masas, para más de 16000 sustancias orgánicas por lo cual es de gran utilidad especialmente para estudiantes de química, bioquímica o investigadores de ciencias afines como la medicina.

La base de datos es bastante intuitiva y por ejemplo te deja buscar compuestos por su nombre tradicional en ingles, por ejemplo para la cafeína:

La búsqueda nos devuelve el siguiente resultado:

Lo que nos indica que para este compuesto están disponibles su espectro de masas, infrarrojo, de resonancia magnética nuclear protónico y de carbono 13, si escogemos el espectro de infrarrojo nos mostrará lo siguiente:

De igual manera tenemos la posibilidad de buscar compuestos, fórmula molecular, peso molecular, número de registro CAS, por picos característicos en IR, por desplazamientos químicos en RMN protónico y Carbono 13 y por picos e intensidades en espectroscopía de masas, esta es una gran herramienta para confirmar la identidad de un compuesto desconocido a partir de la comparación con los resultados de espectros disponibles en la base de datos o para aprender sobre espectrosocopía de una manera más profunda ya que se contaría con miles y miles de espectros para aprender.

No siendo más me despido, agradeciendo como siempre su atención.

4 thoughts on “Ciencia en Linux: AIST:RIO-DB una grandiosa base de datos de espectros de compuestos orgánicos

  1. Información Bitacoras.com…

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